MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 102688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	AAT	2	6	2	7	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014150	ATA	2	6	21	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014150	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014150	GAT	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014150	GAAT	2	8	155	162	50 %	25 %	25 %	0 %	296125059
6	NC_014150	ATT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
7	NC_014150	GAT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
8	NC_014150	TTG	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125059
9	NC_014150	ATA	2	6	241	246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
10	NC_014150	GCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125059
11	NC_014150	TGC	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125059
12	NC_014150	A	7	7	290	296	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
13	NC_014150	A	7	7	314	320	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
14	NC_014150	T	6	6	321	326	0 %	100 %	0 %	0 %	296125059
15	NC_014150	ATA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
16	NC_014150	GAA	3	9	402	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125059
17	NC_014150	A	6	6	427	432	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
18	NC_014150	ATA	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
19	NC_014150	A	7	7	464	470	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
20	NC_014150	TAA	3	9	479	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
21	NC_014150	ATT	2	6	502	507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
22	NC_014150	AAT	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
23	NC_014150	AGC	2	6	557	562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125059
24	NC_014150	GTAT	2	8	566	573	25 %	50 %	25 %	0 %	296125059
25	NC_014150	TA	3	6	699	704	50 %	50 %	0 %	0 %	296125059
26	NC_014150	A	6	6	750	755	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
27	NC_014150	GAT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
28	NC_014150	CTT	2	6	816	821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125059
29	NC_014150	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
30	NC_014150	GCA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125059
31	NC_014150	CCT	2	6	912	917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125059
32	NC_014150	A	6	6	947	952	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
33	NC_014150	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
34	NC_014150	CCT	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125059
35	NC_014150	TAT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
36	NC_014150	ATT	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
37	NC_014150	AT	3	6	1070	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	296125059
38	NC_014150	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125059
39	NC_014150	AAGA	2	8	1100	1107	75 %	0 %	25 %	0 %	296125059
40	NC_014150	TGA	2	6	1147	1152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
41	NC_014150	ATT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
42	NC_014150	A	6	6	1226	1231	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
43	NC_014150	A	7	7	1251	1257	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
44	NC_014150	ATT	2	6	1267	1272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
45	NC_014150	TCT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125059
46	NC_014150	TA	3	6	1343	1348	50 %	50 %	0 %	0 %	296125059
47	NC_014150	A	7	7	1367	1373	100 %	0 %	0 %	0 %	296125059
48	NC_014150	ATA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
49	NC_014150	AAG	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125059
50	NC_014150	ATTT	2	8	1468	1475	25 %	75 %	0 %	0 %	296125059
51	NC_014150	A	7	7	1531	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014150	A	6	6	1541	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014150	AT	3	6	1563	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014150	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014150	CCT	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014150	T	6	6	1635	1640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014150	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014150	TA	3	6	1687	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014150	ATA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014150	T	7	7	1721	1727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014150	ATA	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014150	ATA	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014150	TATT	2	8	1751	1758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014150	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014150	T	6	6	1820	1825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014150	AT	3	6	1826	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014150	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014150	AAT	2	6	1863	1868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014150	AT	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014150	TTTG	2	8	1907	1914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014150	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014150	A	7	7	1950	1956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014150	T	6	6	1974	1979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014150	AT	4	8	1982	1989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014150	TAA	3	9	2021	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014150	GAA	3	9	2054	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
77	NC_014150	TAA	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
78	NC_014150	AAT	2	6	2111	2116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
79	NC_014150	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
80	NC_014150	ATA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
81	NC_014150	AAAG	2	8	2147	2154	75 %	0 %	25 %	0 %	296125060
82	NC_014150	GAA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
83	NC_014150	GCT	2	6	2168	2173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125060
84	NC_014150	ATG	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
85	NC_014150	A	6	6	2198	2203	100 %	0 %	0 %	0 %	296125060
86	NC_014150	GCA	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125060
87	NC_014150	AT	3	6	2245	2250	50 %	50 %	0 %	0 %	296125060
88	NC_014150	A	6	6	2298	2303	100 %	0 %	0 %	0 %	296125060
89	NC_014150	ATT	3	9	2332	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125060
90	NC_014150	GTT	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125060
91	NC_014150	ATG	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
92	NC_014150	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
93	NC_014150	CCT	2	6	2648	2653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125060
94	NC_014150	TAAA	2	8	2669	2676	75 %	25 %	0 %	0 %	296125060
95	NC_014150	TTA	2	6	2719	2724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125061
96	NC_014150	A	6	6	2741	2746	100 %	0 %	0 %	0 %	296125061
97	NC_014150	TTC	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125061
98	NC_014150	AAG	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125061
99	NC_014150	TAC	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125061
100	NC_014150	TGT	2	6	2875	2880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125061
101	NC_014150	AT	3	6	2910	2915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014150	AACA	2	8	2916	2923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014150	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014150	ATTA	2	8	2961	2968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014150	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014150	AAT	2	6	3000	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
107	NC_014150	AAC	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
108	NC_014150	GTA	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
109	NC_014150	AACA	2	8	3072	3079	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
110	NC_014150	AAC	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
111	NC_014150	TAG	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
112	NC_014150	TAG	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
113	NC_014150	TAAC	2	8	3167	3174	50 %	25 %	0 %	25 %	296125062
114	NC_014150	AGA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
115	NC_014150	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
116	NC_014150	GGAA	2	8	3300	3307	50 %	0 %	50 %	0 %	296125062
117	NC_014150	CTC	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125062
118	NC_014150	AAAC	2	8	3352	3359	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
119	NC_014150	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
120	NC_014150	TAT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
121	NC_014150	CTA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125062
122	NC_014150	AAT	2	6	3483	3488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
123	NC_014150	CAG	3	9	3500	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
124	NC_014150	TATGG	2	10	3517	3526	20 %	40 %	40 %	0 %	296125062
125	NC_014150	A	6	6	3542	3547	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
126	NC_014150	GGT	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296125062
127	NC_014150	AT	3	6	3581	3586	50 %	50 %	0 %	0 %	296125062
128	NC_014150	TGA	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
129	NC_014150	TAAT	2	8	3674	3681	50 %	50 %	0 %	0 %	296125062
130	NC_014150	A	6	6	3700	3705	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
131	NC_014150	AAT	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
132	NC_014150	AAG	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
133	NC_014150	A	6	6	3775	3780	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
134	NC_014150	CAG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
135	NC_014150	A	6	6	3908	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	296125062
136	NC_014150	AGG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125062
137	NC_014150	TAA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
138	NC_014150	CAAA	2	8	4049	4056	75 %	0 %	0 %	25 %	296125062
139	NC_014150	AGC	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
140	NC_014150	TAT	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
141	NC_014150	CTT	3	9	4135	4143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125062
142	NC_014150	ACT	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125062
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